Una ampia sala del Museo è interamente riservata ai Mammiferi, gli unici Vertebrati provvisti di peli e che nutrono la prole con latte secreto dalle ghiandole mammarie della femmina.

Sono presenti esemplari di mammiferi primitivi quali i Monotremi: ornitorinco ed echidna il cui piccolo esce dall'uovo, e i Marsupiali: canguro, opossum e vombata il cui il piccolo termina il suo sviluppo nella tasca addominale della madre.

La temperatura del corpo costante, unita alla specializzazione degli arti ha permesso ai mammiferi di raggiungere e colonizzare quasi tutti gli habitat. Ne sono un esempio la foca e l'otaria, che con una forma del corpo idrodinamica, le pinne robuste e il pelo modificato sono agilissime in acqua e i Pipistrelli che sono gli unici mammiferi ad aver conquistato il volo attivo.

I mammiferi hanno denti altamente differenziati nella forma, nelle funzioni e si sono modificati in base al tipo di alimento. Si possono osservare alcuni rappresentanti degli Insettivori quali il riccio, la talpa, il toporagno con il loro muso allungato e assottigliato all'estremità, il pelame corto e vellutato e i denti acuminati per nutrirsi di piccoli invertebrati. Seguono i Primati con diversi esemplari esposti , i Roditori con i caratteristici incisivi allungati e a crescita continua dei quali segnaliamo la marmotta che di recente è tornata a popolare le Alpi Orobie e l'istrice con i suoi singolari aculei. Fra i Carnivori segnaliamo l'esemplare di lupo, presente sull'Appennino e scomparso dalle Alpi ormai da parecchi anni che assieme all'orso facevano parte delle numerose specie considerate "bestie feroci" e pertanto oggetto di una lotta indiscriminata da parte dell'uomo. L'ultimo esemplare di orso bruno presente in bergamasca fu ucciso nel 1981 ed è qui esposto. I Mustelidi con diverse specie e diversi stili di vita, i grossi carnivori quali la tigre, il leone, il ghepardo e la iena ed altri sono gli esemplari esposti nelle vetrine a rappresentare questo gruppo molto vario che include tante specie diverse fra loro.
Per finire lungo il percorso espositivo sono presenti fra i diversi esemplari esposti alcuni Ungulati che vivono sul nostro territorio ad esempio: il camoscio, lo stambecco, il cinghiale, e da vicino si possono osservare l'elefante e la giraffa.

E' in questa sala del Museo che si possono "toccare con mano" i denti e riconoscere le diverse specie di mammiferi dal pelo, osservare da vicino alcuni campioni di rettili e uccelli e divertirsi con il gioco del mondo.