La stessa linea di gestione del Museo intrapresa da Valle venne mantenuta da Mario Guerra, direttore del Museo dal 1979 al 1997.Nato a Crema nel 1930 e laureatosi in medicina veterinaria all’università di Milano Guerra, esperto ornitologo, dedicò la sua attenzione allo studio degli uccelli non solo del nostro territorio ma anche a quelli dell’Africa orientale. Il suo interesse si è rivolto anche allo studio ed insegnamento delle tecniche della tassidermia che si esplicò nell’organizzazione di due corsi mirati alla formazione di giovani tassidermisti. Abile disegnatore ha prodotto un gran numero di disegni a soggetto naturalistico caratterizzati dal suo inconfondibile stile e da una accuratezza nei dettagli che esprime una profonda conoscenza dei soggetti rappresentati. Nel 1980 curò l’edizione del primo volume della “Rivista del Museo civico di Scienze Naturali E. Caffi” che da allora pubblica articoli inerenti le scienze naturali con particolare attenzione all’attività svolta dal Museo. Nel 1982 diresse la ricostruzione del mammuth che giganteggia nell’ingresso.